銀行限額是會影響到自動扣款的。如果自動扣款的金額超過了銀行卡賬戶的單筆限額或者是超過了銀行要求的單日交易限額，那么就會導致自動扣款失敗，無法成功扣款。如果只是一些續費業務，用戶在之后及時完成繳費就可以了。如果是涉及到貸款的自動還款，還款不及時是會影響到用戶的征信狀況的。

如果遇到銀行卡限額影響到了正常業務辦理的情況，建議用戶要根據限額的情況及時解決相關的問題。如果是銀行卡設置了限額導致的，那么持卡人可以通過手機銀行或者銀行網點柜臺對銀行卡的限額進行調整;如果是銀行卡狀態異常導致的限額，那么需要用戶攜帶銀行卡及身份證前往銀行網點柜臺恢復正常;若是銀行卡賬戶存在安全風險問題，需要用戶前往銀行網點解除風險才可能會恢復正常使用。

總之銀行卡限額比較低的情況下，有時候是會對一些正常的資金交易往來帶來不便的。如果用戶實在不常用這張銀行卡的話，可以選擇只留存小部分的資金，等到有需要的時候再將資金轉會該銀行卡賬戶來進行交易。

造成銀行卡限額的原因有很多種，比如用戶自己設置了銀行卡的交易限額，又比如銀行卡存在安全風險問題被銀行系統限額了，或者銀行卡賬戶異常導致的限額。