回答這個問題之前，首先我們來先了解這兩個概念。
所謂建房用地批準書，實際上是指農村村民享有的宅基地使用權的批準，農民獲得建房用地批準書，就可以按照規定占用土地修建房子，它屬于用益物權，只有農村村民符合一戶一宅規定才能享有的用地權利，具有無期限使用性。
所謂房產證是指房屋產權的證明，主要是指房子的產權證明，房子占用的土地具有規定的使用年限，居民住房房產證的使用年限一般為70年，70年后實際上房子還是個人的，但房子占用的土地使用權是國家的，一般來說，70年使用期限到了，產權人還得續繳土地出讓金才能繼續使用房屋產權。
有農村建房用地批準書，還需要辦理房屋產權證嗎？
農村居民用房，目前國家沒有要求辦理房屋產權證明，現在提出宅基地確權，有些地方開始了宅基地的確權試點，也就是說，符合一戶一宅規定的村民，國家將無償頒發宅基地使用權證，辦這個證的前提條件原則是要有建房用地批準書，但根據農村實際情況，以前修建的農房普遍沒有建房用地批準書，該確權的國家還得要根據實際情況給農民確權，宅基地確權后，實際上相當于房產證，沒有確權的，有房屋建設批準書也是合法的，不需要辦理房產證。
房屋產權證書的辦理，目前我們國家只針對商品房和國有建設用地上批準的自建房，真正農村集體所有權的宅基地是不需要辦理房產證的，有建房用地批準書或宅基地確權證書就證明房屋合法。當然，有些城鄉一體化鄉村，是可以申請辦房屋產權證的，也就是村集體已經改為社區，這樣的地方已經不存在農村宅基地，原有宅基地性質已經改變為國有居民建設用地，居民可以申請辦理房產證。
辦理房產證的程序。
首先、要申請測會公司對房屋進行圖紙設計，這是要自己付費的。
其次、將房屋由村委會出據相關證明，報房管所備案登記，再由房管所出據相關登記證明，到稅務局辦理房產稅，也就是辦房產證需要上稅，按房屋價格15%上繳。
再次、持測會圖紙，房管所備案登記證明及繳稅發票，統到不動產登記中心辦理房產證。
綜上所述，辦理農村建房批準書和宅基地使用權證書，只要符合一戶一宅規定，是不需要上稅的，有建房批準書和宅基地證，代表房屋合法，而且宅基地使用沒有時間限制。辦理房產證需要上稅，而且房產證有一定使用期限。