根據中國證監會對基金類別的分類標準，基金資產80%以上投資于債券的為債券基金。顯而易見，投資債券達到85%就是債券基金。
而在債券基金中又可以概括的分為三類：短債基金、純債基金和普通債券基金。
普通債券基金只需要80%以上投資于債券便可以，可以將小部分資理財序資于股票市場、可轉債市場和打新股等渠道，其風險相較于前兩者較大，通常為中風險基金產品，持有期存在本金損失的可能。也因此，并不建議保守型投資者和謹慎型投資者大比例配置于該類基金。
而短債基金和純債基金都不投資于股票市場和可轉債等，他們僅限于債券市場和貨幣市場。而這兩者的主要區別是短債基金主要投資于貨幣市場（銀行間的債券市場），期限在一年以內；而純債基金主要投資于債券市場，期限通常在一年以上。
那么什么是貨幣市場？什么是債券市場呢？貨幣市場是指期限在一年以內的金融資產交易的市場，特點是強流動性，參與者主要為金融機構，標的物主要為國庫券、商業票據、銀行承兌匯票、可轉讓定期存單、回購協議等。
而債券市場是發行和買賣債券的場所，期限通常在一年以上，比如三年國債，5年企業債等，其特點是收益率相對較高，參與者包括機構和個人投資者，標的物主要為國債、金融債、企業債和可轉債等。
那么從標的物來看，貨幣基金跟短債基金是類似的，貨幣基金主要投資標的為短期貨幣工具，注重的是比短期債券更短期的銀行間債券市場（貨幣市場），并且嚴格規定平均剩余期限不超過120天。
也就因為其期限較短，相應的流動性較強。所以，貨幣基金的流動性要強于短債基金，風險性更低。當然，收益也相對較低。
除了投資標的期限之外，貨幣基金區別于短債基金還在于現金留存，比如貨幣基金存在較大的現金比例，以備人們隨時贖回，增強其流動性。而短債基金卻沒有相應嚴格的要求，風險性也就在貨幣基金之上。
除此之外，貨幣基金和債券基金在計算方法上也存在差異，攤余成本法每日計提收益，而債券基金（包括短債基金）都以凈值累計的方法計算收益。