1、繳納的保費不同

新農合的保費是比較便宜的，每個月通常只需要小幾百元。而城鎮社保和職工社保的保費相對比較貴，每個月的保費一般是需要上千元的。

2、報銷比例不同

報銷一般涉及到的就是社保中的醫療保險，而新農合的報銷比例和職工醫保、城鎮醫保的報銷比例也會有些不同。在鄉鎮醫院，新農合的報銷比例較高；但如若是在市級醫院中，則城鎮、職工社保的報銷比例較高。

新農合和社保是不可以同時交的。簡單來說，新農合也是社保的一種，只不過依據參保人戶籍類型的不同，而分為新農合和社保，通常，持有農村戶口的參保人需要參保新農合；而持有城鎮戶口的參保人需要參保城鎮居民社保；在職職工則繳納的是職工社保。

因此，參保人只要參保了新農合就無法同時參與社保，如果在參保的過程中，參保人的戶籍類型發生了變化，比如由農村戶口轉換成城鎮戶口的時候，參保人也需要相應的到當地的社保經辦中心辦理社保類型的轉換。